Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms