Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WWV3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms