Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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