Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DTX3Q8N9I9 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms