Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms