Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms