Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms