Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FXNQ16595 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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FXNQ16595 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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FXNQ16595 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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FXNQ16595 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FXNQ16595 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FXNQ16595 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FXNQ16595 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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