Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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