Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CHD4Q14839 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CHD4Q14839 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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CHD4Q14839 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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CHD4Q14839 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
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