Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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RFTN1Q14699 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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RFTN1Q14699 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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RFTN1Q14699 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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