Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CNGB1Q14028 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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CNGB1Q14028 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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CNGB1Q14028 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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CNGB1Q14028 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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