Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms