Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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