Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
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