Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms