Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms