Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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