Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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ITGB3BPQ13352 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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ITGB3BPQ13352 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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ITGB3BPQ13352 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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ITGB3BPQ13352 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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ITGB3BPQ13352 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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ITGB3BPQ13352 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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