Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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