Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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