Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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