Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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SGF29Q96ES7 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGF29Q96ES7 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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