Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms