Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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