Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC02549-201ENST00000445346 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP001782.1-202ENST00000527774 445 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CYP4A26P-201ENST00000563017 196 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 DHRS9-203ENST00000421653 1044 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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