Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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CCDC85BQ15834 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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CCDC85BQ15834 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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CCDC85BQ15834 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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CCDC85BQ15834 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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CCDC85BQ15834 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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CCDC85BQ15834 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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CCDC85BQ15834 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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CCDC85BQ15834 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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CCDC85BQ15834 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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