Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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CUL4AQ13619 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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CUL4AQ13619 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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