Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms