Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SRSF4Q08170 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms