Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms