Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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AP3M2P53677 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
AP3M2P53677 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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