Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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