Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
ANKRD40Q6AI12 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ANKRD40Q6AI12 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms