Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDK4Q16654 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms