Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms