Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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GRIK4Q16099 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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GRIK4Q16099 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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GRIK4Q16099 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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GRIK4Q16099 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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GRIK4Q16099 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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GRIK4Q16099 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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GRIK4Q16099 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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GRIK4Q16099 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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