Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms