Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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