Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms