Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ALCAMQ13740 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms