Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SP140Q13342 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms