Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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SEMA3BQ13214 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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SEMA3BQ13214 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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