Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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