Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXO1Q12778 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
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FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXO1Q12778 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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