Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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HOXD8P13378 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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HOXD8P13378 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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HOXD8P13378 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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HOXD8P13378 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD8P13378 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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