Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms