Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP290O15078 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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