Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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CLDN19Q8N6F1 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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