Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms